پاسخ بوسیله مقاله ی: منشا و تکامل مداوم SARS-CoV-2

AAAAAAAاخیراGHAROOOONGHAROOOONGHAROOOONGHAROOOONGHAROOOONGHAROOOONGHAROOOON تجزیه و تحلیل ژنتیکی درمورد شیوع ویروس کرونا متاخر به وسیله ی تانگ و همکاران در رومه ی National Science Review منتشر شده است (این مطالعه در زومیت نیز گزارش شد). بنا به گفته ی فدایی پژوهشگران، دو مورد از ادعاهای واقعی این مقاله با برداشت لغزش و توجیه افراطی داده های SARS-CoV-2 حاصل شده است و تو تجزیه و تحلیلی که ادا شده است، مشکلات روش شناختی همچنین به چشم می خورد.ادعای اول

انتقاد اول درمورد این ادعا است که درون این شیوع دو نوع کاملا مشخص از ویروس SARS-CoV2 وجود دارد که آن ها دارای مقدار انتقال متمایزی هستند. تانگ و همکاران این دو نوع را انواع L و S S می نامند و می گویند S نوع S همان جنس اجدادی است و نوع S L از S تکامل. مشهود کرده است طبق نتایج آن ها، این دو نوع ویروس به طور واضح (براساس دو اسنیپ چند: شکلی) مورد نوکلئوتیدی SNP.

متناسب تعریف هستند یک تیک غیرمترادف که ازنظر اهمیت عملکردی مورد تخمین فراغت نگرفته است، نه بخاطر» مدح جنس نمودار کافی است و نه بخاطر رک». (کردن نوع حقیقی جستن غیرمترادف جهشی است که توالی اسید آمینه ای یک پروتئین را تغییر می دهد و جستن مترادف، جهشی است که توالی اسید آمینه ای یک پروتئین را).

تبدیل نمی دهد از تاریخ دوم مارس ۲۰۲۰، ۱۱۱ جهش غیرمترادف درون عالمگیر. شناسایی شده است درحال حاضر، هیچگاه مدرکی مبنی پیاده شدن اینکه هرکدام از این ۱۱۱ تشنج درون شدت مصیبت زایی یا نرخ انتقال ویروس نقش داشته. باشند، موجود نیست بااین حال، آن ها ادعای دیگری نیز کرده و می گویند این دو نوع دارای ارزش:واگذاری متفاوتی هستند ما دریافتیم که اگرچه نوع S L از جنس S مشتق شده است، درمیان ژنوم های گلچین-ترادف-شده ی SARS (CoV 2، سنخ) L حدود ۷۰ درصد S (شایع نمدار از) جنس. S حدود ۳۰ درصد است این الگو نشان می دهد که S نوع L نسبت به نوع S.

از بها واگذاری بالاتری برخوردار است چکیده ی مقاله از این هم:فراتر S رفته و صراحتا می گوید جنس S که ازنظر تکاملی.

باستانی زیرفون و کمتر تر تهاجمی است باید دانست که مشاهده ی جهشی خاص در بیشتر معیار ها وما به این معنا نیست که ویروس حامل. آن جهش، اسودگی خیس منتقل می شود بخاطر تأیید این ادعا، حداقل باید مقادیر به دست آمده را با مقادیر مورد انتظار مادون توزیع صفر. و تصور نرخ واگذاری موافق مقایسه کرد از آن جایی که پژوهشگران این طور کاری انجام نداده اند، شواهد کافی بخاطر نمایش ی این پیشنهاد وجود ندارد و این روند نادرست و غیرمسئولانه است که بگوییم تفاوتی.درون نرخ ارجاع:دو نوع وجود دارد مقاله های مرتبط دانشمندان دو سویه مختلف از ویروس کرونا عامل کووید ۱۹ کشف کردندنگاهی به تأثیر ویروس کرونا متاخر بر اعضای مختلف بدناحتمالا همه مبتلا خواهیم

شد؛ چرا ویروس کرونا جدید مهارشدنی نیست؟ تفاوت های مشاهده شده بوسیله ظن. بیش شاگرد از اثرات اپیدمیولوژیک تصادفی است تئوری تکاملی محور پیش بینی می بطی ء که فراوانی جنبش هایی که ازنظر انتخابی خنثی هستند، با» گذشت زمان و طی. فرایند رانش ژنتیکی دچار تغییر می شود در سیلان شیوع ویروس، رویداد ارجاع ویروس از یک فرد آلوده به. فرد دیگر یک رویداد احتمالی تصادفی است برخی افراد مقدور است بیشتر از دیگران ویروس را منتقل کنند به دلایل مختلفی مثلا اینکه در کف مشت خویشتن سرفه می کنند و از وسایل.نقلیه ی اشتراکی بهم خورده استفاده می کنند این پدیده های کوچک اپیدمیولوژیک طی زمان شلوغی می یابند و تنوع قابل توجهی را در فراوانی جهش هایی که در روانی یک.

عالمگیر دیده می شود، ایجاد می کنند علاوه براین، وقتی ویروس به قلمرو خواه منطقه ی جدیدی بااطلاع می شود که قبلا آلوده» نبوده است،. امکان پذیر است معلول بنیان گذار قیافه دهد ازآن جایی که طی همگی گیری، نسخه های معدودی از ویروس به سرعت پراکنده می شود، هرگونه پریدن در ویروس های اولیه، حتی اگر در آغاز در کشوری که بلای ناگهانی از آن منشا پژمان است، کمیاب. بوده باشد، به سرعت بسی می شود این امر مخصوصا ممکن است در شیوع کنونی-که-بوسیله وسیله ی ویروس جدید SARS CoV 2 ساختن شده است، اتحاد افتد؛ از طرف میزبان. های مستعد زیادی برای ویروس وجود دارند براین اساس، فراوانی یک جهش خاص به خودی خود.

مدال دهنده ی شکوه عملکردی آن نیست همچنین درک این مسئله مهم است که هرچه جمعیت ویروس کوچک زیرفون باشد، حدس اینکه این طور تغییرات کوچکی فراوانی تشنج ها. را تحت تأثیر قرار دهند، بیشتر است باتوجه به اینکه به رویت می رسد این پریدن بی شمار زود و وقتی که تعداد افراد آلوده ی کمتری وجود داشتند، قیافه داده باشد، فراوانی آن احتمالا.زیر تأثیر

بیرون کردن ژنتیکی قرار اندوهناک است ادعای دوم تانگ و همکاران، فراوانی های جهش های غیرمترادف و مترادف را درون داده ها مورد مقایسه استراحت داده و ادعا می کنند انتخاب، فراوانی. جستن های غیرمترادف را کاهش داده است این تجزیه و:

انتزاع. به سه برهان دستخوش نقص است ۱ اعداد ارائه. شده در شکل عده دومقاله معنایی ندارد (براساس) این داده ها، فراوانی ۷ جهش مترادف کمتر از ۵۰ درصد و فراوانی دو جهش نیز همچنین بیشتر. از ۹۵ درصد به دست (آمده است) نگاهی گذرا به درخت فیلوژنی لباس زیر نشان می. دهد که این نمی تواند استوار باشد دراین زمینه، فراوانی به دست آمده باید مربوط بوسیله زمانی. پس از آخرین جد مشترک شیوع باشد برای اینکه دو جهش دارای فراوانی های بالاتر از ۹۵ درصد باشند، باید تعداد کوچکی استاندارد وجود داشته باشد که به نشانی سراب خواهری. از سایر درخت شیوع جدا. شده باشد درحالی که این طور چیزی نیست تنها حالتی که تانگ و همکاران می توانند به این نتایج برسند، آن است که شرایط اجدادی به (نشانی نقطه ای قبل) از آغاز شیوع. یعنی در خفاش ها درنظر پژمرده شود آن ها سپس شرایط اجدادی را برای هر جهش به طور افسون شده ارزیابی می زنند و شجر شیوع فعلی را که. حاوی اطلاعات مفیدی است، بی سابقه می گیرند این نحو تنها هنگام استفاده از یک گونه ی اجنبی خویشاوند برای استباط وضعیت اجدادی تشنج ها در رویه ی دارای. نوترکیبی آزادانه با اجدادی مستقل معنا دارد این-درحالی-است که جدیدترین جد مشترک (SARS CoV 2 و نزدیک ترین) ساربکوویروس یکی از زیرگروه های بتاکروناویروس ها. شبکور مربوط به چند دهه پیش است علاوه براین، در این طور متد هایی باید عدم اطمینان ذاتی همراه با استباط شرایط اجدادی درنظر پژمرده شود که البته تانگ و.



همکاران این طور مسئله ای-را-درنظر نگرفتند درخت فیلوژنی زمانی SARS CoV 2، رنگ ها. علامت دهنده ی موقعیت جغرافیایی معیار است کتاب معیار

 

گیری. ذیل درخت مدال داده شده است ۲ داده های شکل شماره دو مقاله تانگ، بوسیله اشتباه نشان می دهند که برگزینی سره کننده درحال (عمل است درحالی که چنین نبوده است تفویض تمام عیار کننده خواه برگزینی منفی، انتخابی است که درجهت). حذف جستن های زیان بخش انجام می درنگ ارتفاع میله ها، تعداد خام جهش ها را داخل هر فراوانی مورد مقایسه صبر می دهد ولی ارتفاع میله ها را برای درنظر گرفتن تعداد هر گروه. از جنبش ها، نمونه بندی نمی (یواش) از آنجا که تعداد پلی مورفیسم چندشکلی غیرمترادف نسبت به تعداد پلی مورفیسم مترادف در جمعیت بیشتر است و از آنجا که امید می رود (بیشتر پریدن ها در فراوانی پایین)باشند بدون درنظر قبض اجرا برگزینی طبیعی ، این نمایش سبب می شود چنین به نظر برسد که بوسیله طور نسبی.

فراوانی. جهش های غیرمترادف پایین تر است ۳ تانگ و همکاران هنگام تفسیر نتایج، نقش. خطای توالی یابی را درنظر نمی گیرند درنظر اخذ این احتمال مهم است زیرا خطاهای ترادف یابی از آنجا که کمیاب بوده و ارجاع پیدا نمی کنند، تو فراوانی پایینی می مانند اما تشنج های واقعی در هر فروانی دیده می. شوند در مقابل می توانند ارجاع نمایان کنند علاوه به خشکی امدن این، انتخاب خالص کننده عزب روی جنبش های واقعی و. نه خطاهای توالی یابی عمل می یواش بنابراین این گمان وجود دارد که خطای ترادف یابی نسبت غیرمترادف به مترادف بالاتری داشته باشد و این تشنج ها در فراوانی پایینی خواهند بود و رفتار آن ها در زمینه ی کاهش فراوانی جهش های. غیرمترادف، مثل معلول انتخاب خالص کننده است تجزیه و تجرید تانگ مطلقا چیزی.درمورد بود تفویض

خالص کننده نمی گوید مشکلات طرز شناختی نویسندگان مقاله ی مذکور برای برآورد پارمترهای انتخاب. از نرم اسباب PAML استفاده کرده اند این درنگ ابزار قادر به درنظر گرفتن تغییر نرخ جایگزینی مترادف نیست اما پژوهشگران داخل مقاله ی خود می.

گویند که کانون های جهش بود دارد باتوجه به موارد مذکور، پژوهشگرانِ منتقد:مقاله ی تانگ و همکاران می گویند باتوجه به این نقایص ما معتقدیم که تانگ و همکاران باید مقاله ی خویشتن را استرداد کنند زیرا ادعاهای مطرح شده در مقاله ی آن ها بی اساس بوده و در زمانی حساس، اطلاعات نادرست.

 

خطرناکی را:در جامعه منتشر کرده است بیشتر بخوانید ویروس کرونای جدید چگونه پیاده شدن صنعت بازی ویدئویی تأثیر می گذارد؟بحران کرونا در ایتالیا؛ قرنطینه کل کشور می تواند به مهار ویروس کمک کند؟اپل استفاده از جامه دان ضدعفونی کننده را برای پاک کردن آیفون ایمن دانستدستکش می تواند از ابتلا به ویروس کرونا جلوگیری کند؟همه گیری ویروس کرونا [در ایران: از نگاه آمار]